| Baillon, H. E. | 1857 |
Examen des genres qui composent l'ordre des Antidesmees
| Bull. Soc. Bot. France | 1–7 |
| Baillon, H. E. | 1857 |
Les Scepacees doivent-elles constituer un ordre particulier?
| Bull. Soc. Bot. France | 8 |
| Baillon, H. E. | 1858 |
Anthostemidearum sive Euphorbiacearum monandarum descriptionem
| Ann. Sci. Nat., Bot., sér. 4, | 9:192–204 |
| Baillon, H. E. | 1858 |
Recherches sur l'organogenie du Callitriche et sur ses rapports naturels
| Bull. Soc. Bot. France | 337–341 |
| Baillon, H. E. | 1859 |
Monographie des Buxacees et des Stylocerees
| | |
| Baillon, H. E. | 1860 |
Generum novorum quatuor descriptio
| Adansonia | 1: 184–188 |
| Baillon, H. E. | 1860-1861 |
Remarques sur une nouvelle espece de 'menarda' de Madagascar
| Adansonia | 2: 60–64 |
| Baillon, H. E. | 1860-1861 |
Species Euphorbiacearum: Euphorbiacees africaines (de Bourbon, Maurice, Madagascar et Zanguebar)
| Adansonia | 1: 58–87, 139–173, 251–286; 2: 26–55 |
| Baillon, H. E. | 1860-1861 |
Genera Euphorbiacea tria nova
| Adansonia | 1: 50–54 |
| Baillon, H. E. | 1862-1863 |
Observations sur les affinites du genre Barbeuia
| Adansonia | 3: 312–317 |
| Baillon, H. E. | 1862-1863 |
Observations sur les affinites du Macarisia et sur l'organisation de quelques Rhizophorees
| Adansonia | 3: 15–41 |
| Baillon, H. E. | 1862-1863 |
Premiere etudesur les Mappiees
| Adansonia | 3: 354–380 |
| Baillon, H. E. | 1863 |
Sur le Bosqueia, genre inedit de la famille des Artocarpees
| Adansonia | 3: 335–340 |
| Baillon, H. E. | 1863-1864 |
Note sur quelques Xylopia africains
| Adansonia | 4: 140–147 |
| Baillon, H. E. | 1863-1864 |
Descripton du nouveau genre Grisollea
| Adansonia | 4: 211–219 |
| Baillon, H. E. | 1863-1864 |
Note sur le Stelechanteria
| Adansonia | 4: 147–149 |
| Baillon, H. E. | 1864-1865 |
Sur le limites du genre Cephalocroton
| Adansonia | 5: 147–148 |
| Baillon, H. E. | 1865-1866 |
Etudes sur l'herbier du Gabon
| Adansonia | 6: 177–230 |
| Baillon, H. E. | 1865-1866 |
Remarques sur les Dilleniacees
| Adansonia | 6: 254–281 |
| Baillon, H. E. | 1867-1868 |
Memoire sur le famille des Annonacees
| Adansonia | 8: 162–184, 295–344 |
| Baillon, H. E. | 1867-1868 |
Stirpes exoticae novae
| Adansonia | 8: 198–203, 344–351 |
| Baillon, H. E. | 1868-1870 |
Recherches sur le Ravensara
| Adansonia | 9: 298–304 |
| Baillon, H. E. | 1868-1870 |
Du Xanthocercis, genre nouveau de Dalbergiees
| Adansonia | 9: 293–294 |
| Baillon, H. E. | 1868-1870 |
Stirpes exoticae novae.
| Adansonia | ser. 2, 9: 146–152 |
| Baillon, H. E. | 1868-1870 |
Sur les deux genres Potameia et Dilobeia de du Petit-Thouars
| Adansonia | 9: 241–245 |
| Baillon, H. E. | 1870 |
Observations sur le Myosurandra
| Adansonia | 9: 325–330 |
| Baillon, H. E. | 1871 |
Monographie des Papaveracees et des Caparidacees
| | 105–144 |
| Baillon, H. E. | 1871 |
Histoire des Plantes. Monographie des Papaveracees at des Capparidacees
| | 101–144 |
| Baillon, H. E. | 1871-1873 |
Observations sur les Rutacees.
| Adansonia | ser. 2, 10: 299–333 |
| Baillon, H. E. | 1871-1873 |
Stirpes exoticae novae.
| Adansonia | 10: 102–111, 177–185, 240–247, 334–345 |
| Baillon, H. E. | 1872 |
Recherches sur l'organogenie florale des Corylees
| Assoc. Franc. Avancem. Sci. Conf. - Bordeaux | 496–500; 1313–1316 |
| Baillon, H. E. | 1873-1876 |
Stirpes exoticae novae.
| Adansonia | 11: 175–182, 239–273; 292–312, 366–373 |
| Baillon, H. E. | 1874 |
Sur les gousses chinoises de shang-hai et sur les Gymnocladus
| Compt. Rend. Assoc. Franç. Avancem. Sci. | pg. 418–423 |
| Baillon, H. E. | 1874 |
Organogenie florale du Cytinus hypocistis L.
| Compt. Rend. Assoc. Franç. Avancem. Sci. | 424–431; Pl. 4–5 |
| Baillon, H. E. | 1876 |
Sur un nouveau genre Payera.
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 178–179 |
| Baillon, H. E. | 1876-1879 |
Stirpes exoticae novae.
| Adansonia | 12: 220–254, 282–296 |
| Baillon, H. E. | 1877 |
Baclea
| Dict. Bot. | 1: 338 |
| Baillon, H. E. | 1879 |
Sur le Paragenipa.
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(26): 207–208 |
| Baillon, H. E. | 1879 |
Sur les Gaertnera et sur la valeur du groupe des Gaertnerees.
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(27): 208–209 |
| Baillon, H. E. | 1879 |
Monographie des Melastomacees, Cornacees et Ombelliferes
| | 132 |
| Baillon, H. E. | 1880 |
Sur le taloha an hombe de Madagascar
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 278–279 |
| Baillon, H. E. | 1880 |
Sur le nouveau genre Solenixora
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(31): 242–243 |
| Baillon, H. E. | 1880 |
Sur le Pleurocoffea
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(34): 270 |
| Baillon, H. E. | 1880 |
Sur le Cremixora, nouveau type de Rubiacees
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(34): 266 |
| Baillon, H. E. | 1880 |
Remarques sur quelques Mostuea africains
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(31): 244–246 |
| Baillon, H. E. | 1880 |
Sur le nouveau genre Leioclusia
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(31): 244 |
| Baillon, H. E. | 1880 |
Les genres de Cassini Glycideras et Henricia
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 271–272 |
| Baillon, H. E. | 1881 |
Sur le genre Pseudoseris
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 38: 282 |
| Baillon, H. E. | 1881 |
Sur l'Houna-houna de Madagascar
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(38): 301–302 |
| Baillon, H. E. | 1881 |
Sur une balsamine de Madagascar
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 286 |
| Baillon, H. E. | 1882-1894 |
Liste de plantes de Madagascar
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 330–1199 (sporadic pagination) |
| Baillon, H. E. | 1884 |
Etude botanique de l'hazigne (Symphonia fasciculata)
| J. Pharm. Chim., ser. 5 | 5: 456–461 |
| Baillon, H. E. | 1884 |
Les Xylolaena et la valeur de la famille des Chlenacees
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(52): 410–414 |
| Baillon, H. E. | 1885 |
Les nouveaux cafeiers des Comores.
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(65): 513–514 |
| Baillon, H. E. | 1885 |
Constitution du genre Dombeya
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(61): 481–483 |
| Baillon, H. E. | 1886 |
Le genre Humblotia
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1(75): 593–594 |
| Baillon, H. E. | 1886 |
Dichapetaleae
| Fl. Bras. | 12(1C): 365–380, t. 75–78 |
| Baillon, H. E. | 1886 |
Types nouveaux de la flore malgache
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 554–555 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
(none)
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 704 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
Le nouveau genre Siphocolea
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 707–709 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
Observations sur les Gesneriacees
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 717–720 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
Series des Baselles
| Hist. Pl. | 9: 145–148 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
Notes sur les Crescentiées (part 1)
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 678–680 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
Notes sur les Crescentiées (part 2)
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 683–688 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
Notes sur les Crescentiées (part 3)
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 690–695 |
| Baillon, H. E. | 1887 |
Notes sur les Crescentiées
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 85: 678–709 |
| Baillon, H. E. | 1889 |
Types noveaux d'Apocynacées
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 747–752, 757–760, 772–775 |
| Baillon, H. E. | 1889 |
Sur le Craspidospermum
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 2: 805 |
| Baillon, H. E. | 1889 |
Sur trois Stephanotis néo-calédoniens
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 2: 811–812 |
| Baillon, H. E. | 1890 |
Sur les baobabs de Madagascar
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 2: 844–846 |
| Baillon, H. E. | 1890 |
Sur plusieurs Acanthacees a fleurs involucrees
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 2: 820–827 |
| Baillon, H. E. | 1890 |
Le Bonamia de Dupetit-Thouars
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 2: 817 |
| Baillon, H. E. | 1890 |
XCII Asclepiadacées
| Hist. Pl. | 10: 221–304 |
| Baillon, H. E. | 1893 |
Monographie des Graminees
| | 1–334 |
| Baillon, H. E. | 1893 |
Le nouveau genre Anisocyla.
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 1078–1079 |
| Baillon, H. E. | 1893 |
Les plantes alliees aux Tupistra
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1113–1117 |
| Baillon, H. E. | 1894 |
Une Iridacee sans matiere verte
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 2: 1149–1150 |
| Baillon, H. E. | 1894 |
Le nouveau genre Grevellina
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 2: 1160 |
| Baillon, H. E. | 1894 |
Hist. Phys. Madagascar
| Hist. Phys. Madagascar | pl. 400 |
| Baillon, H. E. | 1895 |
Sur un nouveau Didierea
| Bull. Mens. Soc. Linn. Paris | 1: 1182–1184 |
| Baillon, H. E. | 1895 |
Les Didiera de Madagascar
| Bull. Mus. Hist. Nat. (Paris) | 1: 22–24 |